RahuNAS มีแฟ้มค่าตั้งแยกเป็น 2 ส่วนคือ แฟ้มหลัก (Main config) และแฟ้มสำหรับแต่ละ virtual-server (Virtual-server config) โดยแฟ้มทั้งหมด ถูกจัดเก็บไว้ที่ /etc/rahunas ดังนี้
/
+-- [etc]
+-- [rahunas]
+-- apache2.conf
+-- config.php
+-- rahunas.conf
+-- [rahunas.d]
+-- * The rest of RahuNAS virtual-server config file *
apache2.conf - เป็นแฟ้มค่าตั้งของ RahuNAS สำหรับ Apache2 สำหรับตั้งค่าให้กับ RahuNAS Weblogin
config.php - เป็นแฟ้มค่าตั้งของ RahuNAS สำหรับ RahuNAS Weblogin ซึ่งไฟล์นี้ จะถูกแก้ไขเองอัตโนมัติ โดย RahuNAS init script
rahunas.conf - เป็นแฟ้มค่าตั้งหลักของ RahuNAS (Main Config) ภายในประกอบไปด้วย
conf_dir = "/etc/rahunas/rahunas.d"
ค่าตั้งย่อยสำหรับกำหนดตำแหน่งว่า แฟ้มค่าตั้งสำหรับ virtual-server อยู่ที่ใด
log_file = "/var/log/rahunas/rahunas.log"
ค่าตั้งย่อยสำหรับกำหนด log file
dhcp = "yes" | "no"
ค่าตั้งย่อยสำหรับกำหนด เครื่องที่กำลังติดตั้ง RahuNAS มีการติดตั้ง DHCP Server และต้องการใช้งานหรือไม่
bandwidth_shape = "yes" | "no"
ค่าตั้งย่อยสำหรับกำหนด เครื่องที่กำลังติดตั้ง RahuNAS ต้องการที่จะทำ Bandwidth Shaping ด้วยหรือไม่ (ในการทำ Bandwidth Shaping นั้น RahuNAS ต้องการ ifb kernel module สำหรับทำ upload shaping)
bittorrent_download_max = "download limit in kbits"
ค่าตั้งย่อยสำหรับกำหนด อัตราการดาวน์โหลดข้อมูลประเภท Bittorrent สูงสุดที่ระบบจะยอมให้ใช้งานได้ (มีผลกรณีที่มีการตั้งค่า Bittorrent ของ virtual server เป็น throttle และระบบมีการรองรับ Layer7 Filter เท่านั้น)
bittorrent_upload_max = "upload limit in kbits"
ค่าตั้งย่อยสำหรับกำหนด อัตราการอัปโหลดข้อมูลประเภท Bittorrent สูงสุดที่ระบบจะยอมให้ใช้งานได้ (มีผลกรณีที่มีการตั้งค่า Bittorrent ของ virtual server เป็น throttle และระบบมีการรองรับ Layer7 Filter เท่านั้น)